Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Crocc2F6XLV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms