Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10563F6WIE4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10563F6WIE4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms