Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933403O08RikF6UK53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933403O08RikF6UK53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms