Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syngap1F6SEU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms