Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms