Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms