Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd35E9Q9D8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd35E9Q9D8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms