Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Urb2E9Q7L1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Urb2E9Q7L1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms