Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp31E9Q6Y8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms