Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf11E9Q6E5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf11E9Q6E5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms