Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ythdc1E9Q5K9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ythdc1E9Q5K9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms