Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BC005561E9Q5E2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BC005561E9Q5E2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BC005561E9Q5E2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms