Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms