Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms