Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hectd4E9Q2E4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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