Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdr17E9Q271 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Wdr17E9Q271 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdr17E9Q271 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms