Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lrp3E9Q1T6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrp3E9Q1T6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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