Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm3893E9Q1I1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms