Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms