Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd2E9PZM4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd2E9PZM4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms