Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gcom1E9PZ54 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gcom1E9PZ54 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms