Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms