Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms