Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms