Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms