Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53aE9PV82 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53aE9PV82 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53aE9PV82 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms