Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Soga1E1U8D0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Soga1E1U8D0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms