Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cngb1E1AZ71 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cngb1E1AZ71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cngb1E1AZ71 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms