Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930595D18RikD3Z642 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930595D18RikD3Z642 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms