Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms