Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
5430403G16RikD3Z5L4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms