Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms