Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc6D3YZP9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms