Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc170D3YXL0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms