Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms