Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmf1B9EKI3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmf1B9EKI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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