Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip3B9EHT4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms