Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms