Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3aB2RXC6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3aB2RXC6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms