Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms