Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms