Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clrn2B2RVW2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms