Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4787B2RUD9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms