Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms