Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prrt4B2RU40 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms