Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf518bB2RRE4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms