Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf3B2KF05 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms