Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
NhsB1AV60 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NhsB1AV60 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NhsB1AV60 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms