Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms