Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox1B1APN4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms